故事是讲述世界的人口因为不明原因而急降，逐渐步出历史的舞台，取而代之的是一种平均身高只有10公分、三头身的妖精。这些妖精拥有高智能，而本作的女主角则成为了人类与妖精之间的调停官，负责斡旋在妖精与人类之间的重要事务。虽然如此，由于妖精很少与人类接触，所以女主角根本没什么工作可做，于是她想要好好研究妖精的生态，本作其实就是她与妖精们互动的观察日记了。

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